t be a preferable choice if the prenatal screening on a wide range of pregnancies would be needed.
【Key words】 Muscutar dystrophy Gene deletion Polymerase chain reaction Dystrophin
抗肌营养不良蛋白(dystrophin)基因突变中55%~65%为缺失,5%~10%为重复,8%左右为小的缺失和插入,点突变占25%左右[1]。dystrophin基因缺失分布在不同民族有不同的特点,如在以色列,Duchenne/Becker肌营养不良症(DMD/BMD) 患者dystrophin基因突变中缺失率较低[2],而希腊人和保加利亚人dystrophin基因缺失的断裂点分布有其独特的特点[3,4]。我们利用12对引物(9对引物[5]加7、50和52号外显子扩增引物)检测了56例DMD/BMD患者,分析了缺失型患者dystrophin基因缺失的断裂点分布。并结合国内文献报道,共分析了274例无血缘关系的DMD/BMD患者9对引物检测的总检出率及各引物最佳组合。
资料和方法
一、资料
56例DMD/BMD患者均来自我院神经遗传病专科门诊,其中BMD 5例。所有患者均为男性,年龄8个月至30岁。患者中有6例两两之间有血缘关系。53例无血缘关系的病例中12例有家族史或同胞发病,占23%。除1例8个月男婴为症状前诊断外,其余患者均有典型临床表现并经肌电图、肌酶谱检查证实。此外,结合国内文献221例资料,分析9对引物的总检出率。
二、PCR扩增
9对由Chamberlain设计的引物[5]由中山医科大学遗传病学教研室提供,为了解dystrophin基因缺失在中央缺失热区的断裂点,我们根据Beggs等[6]的设计合成了50、52号外显子扩增引物。将以上11对引物分为5对、4对、3对三组:5对引物为12、17、45、48、51号外显子扩增引物,4对引物为4、8、19、44号,3对引物为50、51、52号。每次扩增均同时设空白和正常对照。缺失的外显子再以单一引物PCR扩增验证1次。为了解7号内含子的断裂情况, 我们合成了7号外显子扩增引物,引物序列如下:7F:GCATGGAAGTAAATCTCATGGAAC;7R:GTGTAG-AAATGACAAGTCTCAGATG,扩增产物为279 bp。
结果
56例患者中28例至少有1个外显子缺失。53例无血缘关系的患者中27例有基因缺失,总检出率为51%。累及中央缺失热区的缺失24例,总检出率为45%, 占检出病例的89%。根据检测结果,在27例缺失的54个断裂点中,72%的断裂点位于44~51号内含子,50%的断裂点位于45~51号内含子。确定位于7、44、50和51号内含子内的断裂点共30个,22%、17%、13%的断裂点分别位于44号、50号、51号内含子。7号内含子断裂较少,仅4%的断裂点位于该内含子。
结合文献资料[7-14], 274例DMD/BMD患者9对引物的总检出率为48%。对207例有完整资料的病例分析表明,48号外显子缺失最常见,45、51、17号外显子次之,它们各自的总检出率分别为28%、20%、16%、10%,分别占9对引物检出人数的57%、42%、33%、22%。4、8号外显子缺失少见,仅占总检出率的1%、5%。两对引物的组合以48号和17号组合检出率最高,总检出率为35%,检出人数占9对引物检出人数的73%。3对引物的最佳组合为48、45和17号,总检出率为41%,占9对引物检出人数的84%。4对引物的最佳组合为48、17、45和51号,总检出率为44%,占9对引物的91%。5对引物(增加12号)总检出率可达46%,占9对引物检出人数的96%。
讨论
dystrophin基因突变55%~65%为缺失,且主要分布在两个区域。中央缺失热区位于44~53号外显子区域,占所有缺失的70%左右;5′端缺失热区位于3~19号外显子,占20%左右。Chamberlain等[5]的9对引物可检测出80%的缺失患者,Beggs等[6]又增设了另9对引物(肌肉特异性启动子、外显子3、6、13、43、49、50、52和60号),发现这18对引物可检测出98%的缺失患者。
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