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自身抗原52 kD

TG PLRPF FSPGF NDGGK NTAPL TLCPL NIGSQ GSTDY。
1.2 序列的计算机分析 将52 kD-Ro/SSA序列输入计算机,分析蛋白质等电点曲线,用Kyte-Doolittle氨基酸亲水标准及7个残基一组的预测方案作亲水性分析[1]。用Emini方法预测表面可及性,用Karplus-Schulz标准分析肽链柔性。用Chou-Fasman(CF)和Garnier-Osguthorope-Robson(GOR)方法模拟蛋白质二级结构。Jameson-Wolf 方法进行抗原性分析[2]。

2 结果
2.1 52 kD-Ro/SSA蛋白质分子基本组成结构分析 根据52 kD-Ro/SSA蛋白质等电点曲线计算出等电点为6.35(图1),进一步对序列组成的功能位点进行分析,表明第421位的N为潜在的糖基化位点。

 

图1 52 kD-Ro/SSA等电点PI值
Fig.1 Isoelectric point of 52 kD-Ro/SSA

2.2 52kD-Ro/SSA亲水性及表面可及性分析 亲水性分析表明残基120~250、300~400位为52 kD-Ro/SSA亲水性较强的区域。表面可及性分析结果表明整个分子可及性较差,120~200、300 位附近有易接近区。
2.3 52 kD-Ro/SSA肽链柔性分析 结果显示150~210、320~330位Bnorm值较高。
2.4 52 kD-Ro/SSA二级结构预测 显示在120~230位有α螺旋结构。
2.5 52 kD-Ro/SSA抗原性分析 可见120~130、300~320和360~380位间抗原性预测值较高。

3 讨论
  蛋白质分子的表位往往位于那些较充分暴露于溶剂或带电的亲水性氨基酸富集的部位,因此对蛋白质的氨基酸序列带电性、极性和疏水性进行分析就可估计出局部亲水性强的区域即表位。在蛋白质分子表面的抗原位点与抗体结合区大小一致的球状结构间有较高的表面可及性,因而根据抗原区域的立体化学征可估算“突出指数”(PI)值,高PI值与抗原位点间有显著相关性。蛋白质的柔性区,即构象可变的柔性肽,使蛋白质的多个结构域间可以自由运动,适应多变的结合配体,扩大了与配体结合的范围。蛋白质的伸展构型还有助于功能区的正确折叠,形成具有生物活性的空间结构。Karplus 和Schultz 方法是基于α碳原子的B因子来预测链柔性的,其Bnorm值在疏水区较低,尤其是在蛋白质疏水内核、抗体不能结合的区域。蛋白质的二级结构对抗原决定簇的位点也有一定作用。Jameson和Wolf根据前人成果,建立了抗原性预测分式:Ai=Σ0.3(Hi)+0.15(Si)+0.15(Fi)+0.2(cFi)=0.2(RGi),Ai 值高即抗原位点可能性高。
  本文分析蛋白质分子亲水性、表面可及性、柔性,并模拟其二级结构,预测其主要抗原位点,结果表明52 kD-Ro/SSA的等电点为6.35,亲水性分析结果显示120~250、300~400为52 kD-Ro/SSA亲水性较强的区域。整个分子表面可及性较差,在120~200、300位附近有易接近区。肽链柔性分析结果显示150~210、320~330位Bnorm值较高。根据CF法和GOR法模拟的52 kD-Ro/SSA蛋白质二级结构显示在120~230位间有α螺旋结构,这可能对于维持抗原决定簇的骨架结构有一定作用。其抗原性分析显示120~130、300~320和360~380位间抗原性预测值较高。综合分析以上结果表明自身抗原52 kD-Ro/SSA可能是多抗原位点,其中在120~130、300~320和360~380间抗原性较强。
  52 kD-Ro/SSA蛋白质含475个氨基酸,3个区:①N端,富含赖氨酸/组氨酸,形成DNA/RNA连接结构“锌指”结构,参与DNA或RNA识别。②中央区域,含亮氨酸链结构,是α螺旋组成的螺线图结构,有助于形成分子内二聚体。③C端“rfp样”区。过去研究表明,在不同来源患者及不同疾病(如SLE和SS)间,抗体识别的区域有所差异,提示自身免疫反应受到不同的遗传学和环境因素的调控[3]。

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