自身抗原52 kD

邓安梅　仲人前　陈孙孝　孔宪涛　

　　中国图书分类号　R392.11
　　摘　要　目的：分析自身抗原52 kD-Ro/SSA的序列结构，预测其抗原位点。方法：将自身抗原52 kD-Ro/SSA的氨基酸序列输入“蛋白质结构预测”软件包，分析蛋白质分子亲水性、表面可及性、柔性，并模拟其二级结构，预测其主要抗原位点。结果：自身抗原52 kD-Ro/SSA是多抗原位点，其氨基酸序列中120～130、300～320、360～380位间抗原性较强。结论：确定52 kD-Ro/SSA的抗原优势表位，为研究抗原抗体间相互作用及其疾病机制打下基础。
　　关键词　自身抗原52 kD-Ro/SSA　序列分析　抗原表位

Antigenicity prediction of autoantigen 52 kD-Ro/SSA
DENG An-Mei,ZHONG Ren-Qian，CHEN Sun-Xiao et al.Clinical Immunology Center,Changzheng Hospital,Shanghai 200003

　　Abstract Objective:To predict antigenicity of autoantigen 52 kD-Ro/SSA.Methods:The hydrophilicity accessibility,secondary structure and antigenicity index of autoantigen 52 kD-Ro/SSA were predicted by “Peptide structure prediction” procedure. Results:Dominant epitopes exist in 120～130,300～320,360～380 sites of the sequence of 52 kD-Ro/SSA.Conclusion:The dominant epitopes of 52 kD Ro/SSA were determined and the result will help to understand 52 kD-Ro/SSA-antibody interaction and the pathogenesis of 52 kD-Ro/SSA related autoimmune diseases.
　　Key words Autoantigen 52 kD-Ro/SSA Sequence analysis Antigen determinants

　　　抗52 kD-Ro/SSA的自身抗体出现于系统性红斑狼疮(SLE)、干燥综合征(SS)等自身免疫病患者血清中，可能参与疾病的发病机制。已克隆获得52 kD-Ro/SSA 的基因，并在体外培养中得到表达。蛋白质的基因和氨基酸序列中蕴含着重要的信息，利用序列分析软件可进行序列分析与比较，获得许多重要发现。本文应用蛋白质数据与序列分析软件程序包，分析了SLE中自身抗原52 kD-Ro/SSA蛋白质分子性质和结构特点，寻找其特征性结构位点，为进一步的结构-功能研究打下了基础。

1　材料与方法
1.1　蛋白质序列　52 kD-Ro/SSA氨基酸序列如下: MASAA RLTMM WEEVT CPICL DPFVE PVSIE CGHSF CQECI SQVGK GGGSV CAVCR QRFLL KNLRP NRQLA NMVNN LKEIS QEARE GTQGE RCAVH GERLH LFCEK DGKAL CWVCA QSRKH RDHAM VPLEE AAQEY QEKLQ VALGE LRRKQ ELAEK LEVEI AIKRA DWKKT VETQK SRIHA EFVQQ KNFLV EEEQR QLQEL EKDER EQLRI LGEKE AKLAQ QSQAL QELIS ELDRR CHSSA LELLQ EVIIV LERSE SWNLK DLDIT SPELR SVCHV PGLKK MLRTC AVHIT LDPDT AMPWL ILSED RRQVR LGDTQ QSIPG NEERF DSYPM VLGAQ HFHSG KHYWE VDVTG KEAWD LGVCR DSVRR KGHFL LSSKS GFWTI WLWNK QKYEA GTYPQ TPLHL QVPPC QVGIF LDYEA GMVSF YNITD HGSLI YSFSE CAF

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