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蛋鸡品系RAPD变异及其与杂种优势关系的分析 |
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品系的群体遗传变异,重点研究了RAPD多态性与纯系杂交后代生产性能表现及其与杂种优势率的关系,探索将RAPD标记用于预测杂种优势的可行性。
1 材料和方法
1.1 试验动物 试验鸡群由广州市力康联合公司提供,包括1978年引进的科伯特a系、d系、e系,1982年引进的哈巴德h系,以及从1986年引进的海兰W-36分化而成的l系。 1.2 血液样品采集和模板DNA的制备 分别从a、d、e、h、l各个品系随机抽出20只母鸡、10只公鸡采集血样1.5ml/只。制备血浆及溶血液, 抽提DNA〔3〕。 1.3 血液蛋白质多态性检测 本实验共检测了淀粉酶Amy-1、酯酶Es-l、碱性磷酸酶Akp-l和血红蛋白Hb-1等 4 个座位的多态性。电泳方法同殷雅明等〔4〕。 1.4 RAPD-PCR扩增 用150个10碱基随机引物(编号为OPA1-20、OPB1-20、OPC1-10、OPDl-20、OPFl1-20、OPG1-20、OPH1-20、OPI1-20)和4对随机引物双引物组合(组成为OPAl+OPBl、OPA7+OPB2、OPA6+OPB6、OPH5+OPH7),对5个品系的混合DNA样品进行PCR扩增。根据实验结果筛选6个引物和l对双引物组合(OPB8、OPB13、OPG4、OPH4、OPH19、OPI4和OPH5+OPH7)分别对5个品系的个体DNA样品(20个/系,10♂+10♀)进行PCR扩增。 l.5 数据统计分析 1.5.1 由血液蛋白质多态性资料计算遗传距离(Genetic distance DN) 根据Nei〔5〕的方法。 1.5.2 RAPD分析 (1)群体内相似性系数(Similarity coeffcient,S)〔5, 6〕,S=2nxy/(nx+ny),其中nxy为一群体中个体x和y共有带的数目,nx、ny分别是个体x、y具有条带数。 (2)遗传距离 使用作者推导的一个计算公式〔7〕,计算了5个品系间的遗传距离。 1.6 聚类分析 分别以DN、DS作为距离系数。采用算术平均非加权对群法(Unweight Pair-group Method with Arithmetical Average,UPGMA)〔8〕,对上述5个品系进行聚类分析,并绘出聚类树形图。 1.7 纯系及杂交F1代的各性能成绩及杂种优势率 a、d、e、h、l这5个亲本纯系及其16个杂交组合F1代的60周龄总蛋重,60周龄总蛋数和存活率 3个性能成绩的测定工作于1993~1994年在力康公司进行,得到的观测值见表3。根据以上观测值计算了F1代各性能的杂种优势率。 1.8 简单线性相关分析 对遗传距离DN与DS进行相关分析, 同时, 对二元杂交后代的60周龄蛋重及其杂种优势率、蛋数及其杂种优势率、成活率及其杂种优势率与亲本纯系内的遗传距离DS、父系内相似性系数、母系内相似性系数进行简单线性相关分析。
2 结果与讨论
2.1 血液蛋白多态性和等位基因频率 5个亲本品系在Amy-1、Es-1、Akp-1和Hb-1这4 个座位上的等位基因频率列于表1中。这5个品系除了在Hb-1座位上单态外,在其他 3个座位上均呈现多态性。另外。它们在Amy-l、Es-1座位的等位基因频率也表现出明显的相似性:5个品系的Amy-l B基因频率均达到0.93以上,甚至为1(a、d、e3个系);Es-l A基因频率除a系为0.7833以外,其他几个品系都在0.9以上。许多研究已显示,Amy-1座位的等位基因频率在家鸡群体中的分布情况与产蛋性能有关〔9, 10〕,来航等蛋用型鸡种Amy-1基因的频率较高,而肉鸡品种Amy-1 A基因的频率较高,本研究结果也显示出这一规律;通过对比一些研究结果〔4, 11〕可以发现, 蛋鸡的Es-1 A基因频率较高(见表1),而肉鸡品种Es-1 B基因频率较高。5个品系在 Akp-1 座位的等位基因频率差异较大,与铃木等所指出的Akp-1的频率在来航和蛋用型杂交鸡中较高的规律不相符合〔10〕。这是否能说明a和l系在选育过程中引进了较多其他鸡种的血缘,或并不存在铃木等所述的规律,还有待进一步证实。
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