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异双聚体电泳及其在遗传学差异筛选中的应用 |
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碱基愈多,泳动速度愈慢,相差距离愈大。实验证明,对于200~800 bp的任何PCR扩增产物,均不需任何特殊的设备,仅靠常规的PAGE电泳即可检出与参考DNA序列的差异程度。 Buonaguro等〔3〕成功地将异双聚体DNA电泳方法用于人HIV-I型病毒V3区DNA序列的遗传学分析及亚型鉴定,取得了满意的效果。本文用此法作为人口腔病原菌基因测序的前奏,亦取得了比较一致的结果。
图1 异双聚体聚丙烯酰胺凝胶电泳图 M.DNA碱基对数标准(λ噬菌体DNA经ECoRI 及Hid Ⅲ酶切片断);1.参考DNA(Pg W50 rDNA间隙区PCR扩增产物);2~14.参考DNA+受检DNA(牙周炎患者龈沟液中Pg阳性菌株rDNA间隙区 PCR扩增产物)。
作者单位:广东省汕头大学医学院生物化学教研室,汕头515031
参考文献
1 Ganguly A, Rock M J, Prockop D J. Conformation-sensitive gel electorphoresis for rapid detection of single-base differences in double-stranded PCR products and DNA heteroduplexes. Proc. Natl. Acad Sci. USA, 1993, 90: 10325~10329 2 Delwart E L, Shpaer E G, Louwagie F Eet al.Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay: analysis of HIV-1 env genes. Science, 1993, 262: 1257~1261 3 Bunaguro L, Gaudio E D, Monaco Met al.Heteroduplex mobility assay and phylogenetic analisis of V3 region sequences of human immunodeficiency virus type 1 isolates from Gulu, Northern Uganda. J. virol., 1995, 69: 7971~7981 4 Leys E J, Gliffen A L, Strong S Jet al.Detection and strain identification of Actionobacillus actinomycetemcomitans by nested PCR. J. Clin. Microbiol., 1994, 32: 1288~1294
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