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成都地区汉族人群中FABP2和F13A1的遗传多态性 |
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andthe polymorphism at F13A1 locus in Chinese population because a deviationfrom Hardy-Weinberg equilibrium has been observed in this Han population.
【Key words】 Polymerase chain reaction Intestinal fatty acid binding protein gene Coagulation factor ⅩⅢ A subunit gene Genetic polymorphism
DNA多态性分析已成为法医学亲子鉴定与个人识别的重要手段。短串联重复序列(short tandem repeat, STR)易于扩增检测,是法医学亲子 鉴定与个人识别的理想工具。单一 或少数几个多态性基因座,其个人识别能力和非父排除能力有限,增加检测位点的数量 可提高个人识别机率及非父排除率。为了建立更多的检验鉴定手段,我们调查了肠脂肪 酸结合蛋白基因(FABP2)B内含子中的一个三核苷酸重复序列[1]和凝血因子ⅩⅢA亚单 位基因(F13A1)A内含子中的一个四核苷酸重复序列[2]在成都汉族群体中的基因型及等 位基因频率分布,现报道如下。
1 材料与方法
1.1 样本DNA 115份EDTA抗凝血采自成都地区无血缘关系的汉族献血员,用Chelex法[3] 提取DNA。 1.2 PCR扩增反应 FABP2基因座采用Polymeropoulos等人推荐的引物,引物序列为:5′ -AACTGAGAACAGTGCCTGAC-3和5-ATTTCCCTCA-AGGCTCCAGGT-3。每一扩增样本含人类 基因组DNA2~40ng,1×Taq缓冲液,1.5mm ol/L MgCl2,150μmol/L dNTP,1U Taq聚合酶(PROMEGA),每一种引物0.25μmol/L, 反应体积25μl,在热循环仪(BIOMETRA)中94℃变性1分钟,58℃退火1分钟,72℃延伸 2分钟,循环28次。F13A1基因座采用Polymeropoulos等人推荐的引物,引物序列为: 5′-GAGGTTGCACTCCAGCCTTT-3′和5′-ATGCCATGCAGATTAGAAA-3′。每一扩增样本含人 类基因组DNA2~40ng,1×Taq缓冲液,1.5mmol/L MgCl2,150μmol/L dNTP, 1U Taq聚 合酶(PROMEGA),每一种引物0.25μmol/L,反应体积25μl,在热循环仪(BIOMETRA)中 94℃变性1分钟,58℃退火1分种,72℃延伸2分钟,循环34次。 1.3 PCR产物的检测和等位基因的确定 用聚丙烯酰胺凝胶不连续水平电泳对PCR扩增产 物进行分型。FABP2及F13A1等位基因分型标准物分别用2~3个不同基因型个体的DNA混合 后,按1.2方法进行PCR扩增制备,制备的分型标准物与英国法庭科学研究所提供的分型 参考样本同步电泳比较,获得命名。样本PCR扩增产物与分型标准物同步电泳,比较样 本PCR产物的电泳谱带对应分型标准物所处的位置,确定样本的FABP2和F13A1基因型。 1.4 数据处理 按文献[4]方法对群体数据作Hardy-Weinberg平衡吻合度检验。
2 结果
2.1 FABP2基因型、等位基因在成都地区汉族群体中的分布我们本次调查了成都地区无血 缘关系的115名汉族个体。观察到10种基因型,5个等位基因。表1列出了FABP2各基因型的 观察值和期望值,图1示电泳分型结果。2.2 F13A1基因型、等位基因在成都地区汉族群 体中的分布我们调查了成都地区无血缘关系的113名汉族个体,观察到8种基因型,5个等 位基因。表2列出了F13A1各基因型的观察值和期望值,图2示电泳分型结果。
3 讨论
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