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应用SSP |
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物序列见表1。设计选自高度多态的HLA-DRB1第二外显子区〔1〕。为组特异性和等位基因特异性扩增引物。
表1 PCR扩增引物及其序列
引物 序 列 特异性
UG115 5 -CGTTTCTTGTGGCAGCTTAAGTT-3 DR1
UG116 5 -CCACGTTTCCTGTGGCAGCCTAAGAGG-3 DR2
UG205 5 -AGACCACGTTTCTTGGAGTACTCTACGTC-3 DR3,5,6
UG117 5 -CGTTTCTTGGAGCAGGTTAAACA-3 DR4
UG118 5 -CAACCACGTTTCCTGTGGCAGGG-3 DR7
UG206 5 -CCACGTTTCTTGGAGTACTCTACGGG-3 DR8,12
UG119 5 -CAACCACGTTTCTTGAAGCAGGA-3 DR9
DR10new 5 -ACCAGACCACGTTTCTTGGAGG-3 DR10
DR RIGHT 5 -ACTCGCCGCTGCACTGTGAAGCTCTC-3 右侧翼全部
1.1.3 SSO探针 23个辣根过氧化物酶(HRP) 标记的序列特异性寡核苷酸探针序列及其杂交相对应的特异性等位基因〔1〕列于表2。
表2 寡核苷酸探针序列
探针 序列 等位基因
DR1N 5 B-GGAGTTCCGGGC-3 1501, 1502, 1503, 0301, 1201, 1202, 1101, 1102, 1103, 1104, 1301, 1302, 1304, 1305, 1306
DR2 5 B-AAGGACTTCCTGGA-3 1601, 1101, 1103, 1104, 1202, 1305, 0801, 0802, 0804, 0805, 09012
DR3N1 5 B-GCCTAGCGCCGAGTAC-3 0405, 0409, 0410, 0411, 0412, 1303, 1304, 0801, 0803, 0805
DR4 5 B-CCTGATGAGGAGTAC-3 1101, 1102, 1103, 1104
DR5N 5 B-GGCCTGCTGCGGAGC-3 1401, 1404, 1407, 1410
DR6N 5 B-CTGTCGCCGAGTCC-3 1201, 1202, 0701, 09012
DR7 5 B-GCAGAGGCGGGC-3 0101, 0102, 0404, 0405, 0408, 0410, 1402, 1406, 1409
DR8 5 B-GAAGACGAGCGGG-3 0103, 0402, 1102, 1103, 1301, 1302, 1304
DR9 5 B-CTGGAAGACAGGCG-3 1601, 1602, 0412, 1101, 1104, 1201, 1202, 1305, 1306, 1403, 0801, 0802, 0803, 0804, 0805
DR10 5 B-AAGCGGGGCCGG-3 0301, 0302, 0303
DR11 5 B-CGGGCCGAGGTG-3 0403, 0406, 0407, 0411, 1401, 1404, 1405, 1407, 1408, 1410, 09012
DR12 5 B-CAGAAGCGGGCC-3 0401, 0409
DR13 5 B-GGGTTGGTGAGAGC-3 0101, 0103, 1502, 1601, 1602, 0302, 0401, 0405, 0407, 0408, 0409, 1101, 1302, 1303, 1305, 1402, 1403, 1407, 1409, 0701, 0801, 0802, 0803, 0805, 09012, 1001
DR14 5 B-GGGTTGTGGAGAGC-3 1501, 1503, 0301, 0303, 0402, 0403, 0404, 0406, 0410, 0411, 0412, 1102, 1103, 1104, 1301, 1304, 1306, 1401, 1404, 1405, 1406, 1408, 1410, 0804
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