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应用SSP |
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刘利民 梁健 宋芳吉 贾静涛
摘 要 对159名中国辽宁汉族个体的基因组DNA进行分析，共检出42种等位基因，其中以DRB1*09012(12.8%)、*0701(10.7%)、*1501(10.4%) 最为常见，其次为DRB1*1201(7.9%)、*1202(7.5%)、*1101(6.6%)、*0301(5.0%)。并发现辽宁汉族人DRB1等位基因频率与白种人间存在明显差异，揭示不同人种有其自己的主要等位基因。同时对本技术在HLA-DRB1分型应用中的优点进行了讨论。
关键词 HLA-DRB1基因分型,SSP-PCR,寡核苷酸探针
中图分类号 Q986,R392.2
Polymorphic Analysis of HLA-DRB1 Gene in Chinese Liaoning Han Population by Sequence Specific Primers-PCR and Sequence Specific Oligonucleotide Probes
LIU Li-Min1) LIANG Jian2) SONG Fang-Ji2) JIA Jing-Tao1)
(1.Department of Forensic Serology;2.First Hospital,China Medical University,Shenyang110001)
Abstract HLA-DRB1 alleles of 159 Chinese donors from Liaoning Han population were determined by using a set of 23 sequence specific oligonucleotide probes directed to various DRB1 alleles. The samples were first amplified and divided into 8 groups by allele/group specific primers. The SSOs enable us to identify 58 different DRB1subtypes. 42 alleles were detected in the study of this population. Among them, the DRB1*09012(12.8%), *0701(10.7%), *1501(10.4%), *1201(7.9%), *1202(7.5%), *1101(6.6%), *0301(5.0%) are the most frequent. The significant difference was found in Chinese northern Han population by comparing the gene frequencies in Caucasoid samples, suggesting that there were principal DRB1 alleles in different races.
Key words HLA-DRB1,Genotyping,SSP-PCR,SSO
人类白细胞抗原是人体内最复杂的遗传多态性系统。HLA Ⅱ类抗原中的DR亚区包含有功能的一个A基因和几个B基因(DRB1, DRB3, DRB4, DRB5和DRB6基因座) 以及几个假基因，其中HLA-DRB1基因具有极大的多态性。已通过序列分析得到WHO命名委员会正式命名的就有70 余种特异性〔1〕。这些等位基因在白种人中已经有了比较多的研究。HLA群体资料表明, 不同人种、不同民族甚至同一民族不同地域人群间的HLA各等位基因频率也有很大差异〔2〕。因此, 检测HLA-DRB1的分布不仅对民族起源分析很必要而且对器官移植配型及某此疾病相关性研究具有重要意义。同时也可为法医学亲子鉴定和个人识别提供重要的统计学数据。
本文采用序列特异性引物(SSP)作PCR扩增分组，再用SSO杂交的方法，对辽宁汉族人群中HLA-DRB1分布进行了研究。结果报告如下。
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 样本 159名无血缘关系的辽宁地区汉族人，取自中国医科大学第一附属医院健康献血员和本教研室收检的亲子鉴定案例血样。
1.1.2 PCR引物 PCR引[1] [2] [3] 下一页
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