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人酪氨酸羟化酶RNA探针制备的研究

(BIO 101)对其进行纯化,即先将切割下来的带有DNA片段的琼脂糖凝胶在50℃溶解于NaI中,以GLASSMILK吸附溶液中DNA,用缓冲液冲洗3次去除杂质后,再将DNA在50℃溶解于水中得到纯化的3.199kb和1.832kb的DNA片段。然后将3.199kb片段在50℃条件下进行去磷酸化反应(1h),经常规抽提后溶解于水中,得到去除磷酸化的3.199kb DNA片段;将上述纯化的1.832kb DNA片段和去磷酸化后的3.199kb的DNA片段按等摩尔浓度混合。加入T4连接酶(PROMEGA) 3个单位在16℃条件下行连接反应16h;以CaCl2法将大肠杆菌XL-1 Blue制备成感受态细胞,加入经连接反应后的混合物冰浴45min,再通过热休克法使DNA进入感受态细胞;将这些细胞悬浮培养在LB(PROMEGA)培养液中,37℃,1h,然后铺在含氨苄青霉素(AMP,5g/L)的LB琼脂培养基上,37℃,16h,共得到63个菌落。
  在培养基上随机取12个菌落,分别置入含有5 ml LB和AMP的12支长试管(20 ml)中进行悬浮培养(37℃,16h);用煮沸法小量从细菌中提取质粒;将培养物离心收获细菌,重悬于STET中,加入溶菌酶(10g/L),混匀后于100℃水浴中加热40s以裂解细菌;离心收集富含DNA质粒的上清液并用常规方法进行沉淀,将12个试管中提取的质粒DNA用限制性内切酶EcoRI消化(37℃,1h)在1%琼脂糖凝胶上进行电泳,以确定拟构建的质粒是否符合设计要求。
  经确定为pGEMTH2质粒后,用碱裂解法大量制备这些质粒,即将100ml菌液离心沉淀,收集出细菌重悬于溶液I(50mmol/L葡萄糖,250mmol/L Tris pH8.0,10mmol/L EDTA pH8.0,溶菌酶10g/L)中,加入溶液Ⅱ(0.2mol/L NaOH,1% SDS)和溶液Ⅲ(3mol/L醋酸钾)裂解细菌;离心收集富含质粒DNA的上清,酚/氯仿抽提,去除蛋白杂质,常规方法沉淀DNA,这样,100ml菌液可得到300μg pGEMTH2质粒。
2. RNA探针的制备
  将上述所制备的pGEMTH2质粒用限制性内切酶XhoI在37℃温度下进行消化,用GENECLEAN药盒纯化,收集TH基因片段;对此片段在绝对无RNA酶的条件下用地高辛RNA标记药盒进行转录标记反应(总体积20μl,37℃,2h),反应体系中含10mmol/L DTT,RNA酶抑制剂20U,ATP,CTP,GTP各1mmol/L, UTP 0.65mmol/L及有地高辛标记的UTP 0.35mmol/L,1.0μg的人TH线性DNA模板和30U的RNA聚合酶37℃ 2h。用限制性内切酶SmaI 25℃消化30min,然后用pH8.0的EDTA 20mmol/L终止反应,加1/10体积的4mol/L LiCl和3倍体积的无水乙醇,在-70℃下,30min沉淀探针,用75%冷乙醇洗涤2次,最后溶解于DEPC处理过的水中,加入RNA酶抑制剂(10IU/L)分装于小试管中,在-80℃下储存。
3. 地高辛标记探针的杂交与检测
  参照文献[3]进行斑点杂交。
  先将含有探针序列的质粒pGEMTH2和phTH2加热变性,用DEPC处理过的水进行稀释(稀释浓度为1g/L,0.1g/L和0.01g/L),然后将稀释的DNA按不同浓度梯度点于尼龙膜上,固定DNA,将膜置于80℃,2h。进行预杂交42℃摇动2h,预杂交液中含有0.75mol/L NaCl,0.1%N-十二烷基肌氨酸,0.02%SDS和1%BSA。在上述体系中加入人TH RNA地高辛标记探针(10μg/ml)进行杂交,在42℃摇动16h,杂交后依次用2×SSC和0.1×SSC洗涤各15min,再用缓冲液洗涤1次。缓冲液中含有0.15mol/L NaCl,100mmol/L Tris-HCl(pH7.5)。用3%BSA封闭非特异性抗原,加地高辛抗体(1∶5 000)室温下温育2h,洗涤后用NBT-BCIP室温显色10min。

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