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不同发育阶段水稻苗高的QTL分析 |
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22个株系）。1997年11月在海南陵水种植亲本和DH群体，随机排列，单本插，每株系种3行，每行10株。
1.2 性状调查及数据分析
在播种后20、50、80、95和110 天 (分别记为第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ阶段) 调查中间10株的苗高（从植株基部至叶片最顶端的距离）。RFLP的分析与作图参见文献〔6〕。采用区间作图法用Mapmaker/QTL软件对不同发育阶段苗高以及两阶段之间的净增长量（分别记为Ⅱ-Ⅰ、Ⅲ-Ⅱ、Ⅳ-Ⅲ、Ⅴ-Ⅳ）进行QTL定位分析，采用LOD值2.0作为阈值来判断QTL的存在，同时还计算了每个QTL 对该性状的贡献率和加性效应〔7〕。
2 结果与讨论
2.1 亲本及DH系的苗高表现
从图1可见, 播种后20天一直到80天，京系17的苗高都高于籼稻窄叶青8号。以后京系17几乎停止生长，在95天时, 窄叶青8号已高于京系17。而DH系平均值在第Ⅰ阶段时较双亲矮，以后阶段则都介于双亲之间。
图1不同发育阶段亲本及DH系的苗高
2.2 苗高的QTL分析
表1列出了对122个DH系苗高及其净增长量的QTL定位结果，5个不同时期和4个净增长量数据共检测到9个QTL，分别位于染色体1，4，6，7，8，11，和12上。其中6个QTL既可在不同时期中检测到，又可用净增长量的数据检测到，另外3个QTL只能用净增长量的数据检测到。SH-4 是一个主基因，它在各阶段都表达，并对苗高的贡献率皆在20%以上。9个QTL中以SH-4、Sh-10、 Sh-11a贡献率最大，都在36%以上，不同阶段检测到QTL对苗高的总贡献率则以第Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ阶段及（Ⅱ-Ⅰ）为最大，都在42%以上。9个QTL中Sh-6、Sh11-a、Sh11-b 和Sh-12的加性效应值是负的，表明ZYQ8有利于苗高的增加, 其他QTL加性效应值是正的，表明JX17有利于苗高的增加，不同阶段检测到的QTL的基因效应值都是一致的，如 Sh-11a 在3个时期中检测到，并都是负值，SH-4 在各个阶段都表达，其加性效应值都是正的，说明各个QTL的效应是稳定的。图1表明, 双亲在80天以后苗高发育进程不同，由表1也可看出第Ⅲ和第Ⅴ阶段所检测到的QTL只有SH-4 是共同的，其它QTL则不同，而Ⅳ-Ⅲ检测到的Sh-6、Sh-10 也是该阶段所特有的，说明苗高发育进程差异反映了QTL表达的差异。
表 1不同发育阶段水稻苗高的QTL
QTL 区间 LOD 贡献率
I II III IV V II-I III-II IV-III V-IV
sh-1 GA506-C949 2.33 11.4
C949-C385 3.77 13.6
sh-4 CT206-CT404 6.83 4.83 46.9
CT404-CT500 4.76 18.5
CT500-CT513 5.54 22.4
CT513-G271 6.66 27.8
C975-RG449 3.21 2.22 11.6
sh-6 CT308B-G294 2.56 8.4
sh-7 RG351-CT469 2.60 11.5
sh-8 G1073-RG1 2.84 2.62 9.3
CT56-G187 3.63 20.7
sh-10 G1082-GA223 3.33 3.67 5.07 14.9
GA223-G291 2.29 2.33 2.54 45.8
sh-11a L190-G1465 2.15 36
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