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人巨细胞病毒单克隆抗体识别的抗原表位的筛选 |
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的同时也得到了它的基因;靶蛋白及其相关基因能富集并放大培养;噬菌体结构简单,易于繁殖,操作方便。
材料与方法 1.HCMV McAb 2E5纯化和标记:此单抗是中和抗体〔2〕,单抗腹水由预防医学院病毒所提供,过Protein A亲和层析柱,纯化的抗体标记生物素。 2.随机六肽文库呈现在fd噬菌体表面蛋白Ⅲ上:文库由新加坡国立大学姚志建教授提供,宿主菌K91Kan。 3.单抗筛选噬菌体随机六肽文库:具体方法参见参考文献〔3,4〕。每孔1μg链亲和素(Biolabs)包被酶联板,用3% BSA(华美)封闭,每孔加入1μg生物素化单抗(本室制备),加10μl肽库,洗去未结合的噬菌体,然后用酸洗脱结合的噬菌体并扩大培养得到次级库,用于下一轮筛选,如此反复三轮。 4.夹心ELISA法检查富集效果:所用试剂同上。 链亲和素包被酶联板,加入生物素化单抗,加各级肽库,加酶标抗噬菌体抗体(本院五所制备),底物显色。 5.DNA序列测定:第三轮洗脱下来的噬菌体感染宿主菌,铺平板,随机挑取16个单克隆,扩大培养,收集纯化噬菌体,提取单链DNA作为模板测序。 6.序列同源性分析:由DNA序列推出氨基酸序列,通过电子邮件经互联网络送往EMBL(欧洲分子生物学库)进行同源性分析。 7.利用计算机软件对HCMV UL01蛋白进行分析:通过远程登陆在瑞士蛋白数据库中调出HCMV UL01的氨基酸序列,用PCGENE软件对此蛋白进行结构分析。
结 果 1.肽库筛选:共进行了三轮筛选,条件均有变化,得到一级库、二级库和三级库。对每一轮的产出率进行了比较(表1),后两轮的产出率高于第一轮,说明了筛选的富集效果。
表1 每一轮筛选产出率 Table1. Yield of each round panning
Round 1 2 3 Eluate 104 105 105 Yield* 10-6 10-5 10-5
*:Yield=Eluate/Adding(1010)
2.夹心ELISA实验结果(表2):结果显示二级库和三级库之间的差别很小,与一级库相比有明显的提高,进一步验证了富集效果。
表2 夹心ELISA实验结果 Table2. The results of sandwich ELISA
First Second Third Primary* 0.32 0.44 0.46 0 A value 0.31 0.42 0.48 0
*:The primary is the negative control
3.序列测定和分析:从三级库中挑取16个单克隆测定其所携带的外源DNA的序列,15个克隆的序列是相同的,5 -AGT GCT GGT TGG GCT TCT-3 ,对应的氨基酸序列为-Ser Ala Gly Trp Ala Ser-,外源序列的一致性很好。 4.序列同源性分析:在EMBL查询的结果显示-SAGWAS-与HCMV病毒膜糖蛋白UL01有78.8%的同源性,其中有四个氨基酸残基(AGWA)是完全相符的。 5.利用计算机软件对HCMV UL01蛋白进行分析∶ (1) HCMV UL01 的氨基酸序列∶ MGMQCNTKLL LPVALIPVVI ILIGTLVPIL LHE QKKAFYW
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