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散发性戊型肝炎病毒部分核苷酸序列分析 |
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阮冰 庄辉 马亦林 陈勇 干梦九 马伟杭 焦扬文
作者单位：310003 杭州，浙江医科大学附属第一医院传染病科
(阮冰，马亦林，干梦九，马伟杭，焦扬文)；
北京医科大学微生物学系(庄辉)；
浙江省医学科学院生物工程研究所(陈勇)
本课题受浙江省自然科学基金(394185)、
浙江省教委(94301)及省卫生厅科研基金资助
【 摘要 】 目的 为阐明戊型肝炎病毒(HEV)毒株的地理分布、流行特征以及研制血清学
诊断试剂和基因工程疫苗提供资料。方法 选择1例浙江仙居山区散发性HE患者，从其血清
中分离HEV RNA，通过逆转录-套式聚合酶链反应法(RT-nPCR)，扩增该散发性HEV(Z-33株)
ORF2区部分cDNA片段(497bp)，然后进行直接序列分析，并与HEV各主要代表株序列作比
较。结果 Z-33株与新疆流行株CH1.1的核苷酸及氨基酸序列同源性分别为96.7%及98.
2%；与缅甸流行株的同源性分别为94.2%及99.1%；与缅甸散发株的同源性分别为95.2%
及99.1%，与墨西哥株的同源性分别为81.8%及94.5%。 结论 浙江仙居散发性HEV Z-33
株和新疆流行株CH1.1一样， 与HEV缅甸株可能为同一亚型。
【 主题词 】 戊型肝炎病毒 聚合酶链反应 序列分析
Partial nucleotide sequencing of hepatitis E virus isolated from a spo
radic case in Zhejiang Ruan Bing,Zhuang Hui,Ma Yilin, et al. Departme
nt of Infectious Disease, The First Hospital of Zhejiang Medical Unive
rsity, Hangzhou 310003
【 Abstract 】 HEV RNA was extracted from the serum of a patient with s
poradic hepatitis E in Xianju, Zhejiang, designated as HEV Z-33 strain.
497 bases of HEV cDNA in ORF2 region was amplified by a reverse transcrip
tion nested polymerase chain reaction(RT-nPCR),sequenced directly an
d compared with those of other HEV strains.The results demonstrated th
at nucleotides and amino acids of the HEV Z-33 were 96.7% and 98.2% homolo
gous with those of the Xinjiang epidemic strain of HEV CH 1.1; 94.2% and
99.1% with the Burma epidemic strain of HEV(B);95.2% and 99.1% with the B
urma sporadic strain of HEV(B);81.8% and 94.5% with the Mexico strain of
HEV(M), respectively. It suggests that the HEV Z-33 strain may belong to t
he HEV(B) subtype, as the CH1.1 strain does.
【 Subject words 】 Hepatitis E virus Polymerase chain reaction S
equence analysis
戊型肝炎(HE)存在流行和散发两种形式。八十年代后期，我国新疆曾发生大规模HE
流行，但目前各地则以散发为主。全面研究散发性戊型肝炎病毒(HEV)的核苷酸及氨基酸序列
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