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感染人体的博尔纳病病毒ORF 基因前部片段的检测 |
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感染动物的BDV的全基因组序列以后〔4〕,已开始陆续报道感染人类的BDV ORF Ⅱ(p23) 基因片段的检测结果〔5〕。1996年Sauder首次报道了检测感染人类的BDV ORF Ⅰ(40)基因中 间片段及测序结果〔6〕,但至今尚未见感染人的BDV ORF Ⅰ基因前部片段的检测的报道。我 们用套式逆转录/多聚酶链反应(nested RT-PCR)检测BDV感染的人体中周围血单核细胞(P BMC)BDV ORF Ⅰ基因前部片段。
材料与方法
1.研究对象:日本福岛地区的5例精神分裂症和4例情感障碍患者以及3例健康献血者经 先前BDV ORFⅡ基因片段检测呈阳性证实已存在BDV感染。其PBMC中总RNA提取后-20℃保 存。
2.试剂:BDV-MDCK标准病毒株由日本北海道大学免疫学血清室提供。nested RT-PC R药盒由日本Toyobo公司和美国Perkin-Elmer公司提供。PCR内外引物及生物探针均自 行设计,由日本Toyobo公司合成提供(附表)。
附表 PCR引物及探针碱基序列
Table. PCR primers and the base sequence of the probe
Rengent Base sequence(5~3) bp Primer(inside) (1) (2) ATGCCACCCAAGAGACGCCT GCCGGTTTAAGGCTGCCATC 54~74 560~580 Primer(outside) (1) (2) TTGATGACGCCGATGCCAT TGATCTGCTCGGCTCCTGCT 77~95 520~540 Probe CGCCTGTTACGCGTGGGGAACAGA 361~384
3.nested RT-PCR:逆转录反应与第一轮PCR同 时进行。在25.5μl总反应体积中含 dNTP 3μl,MnCl 2.5μl,外引物1对各0.5μl,RNase酶活性抑制物1μl,Tth DNA聚合 酶1μl,该酶可逆转录RNA为cDNA和在PCR扩增时延伸引物,待测标本1μl。扩增条件: 60℃30分钟,94℃2分钟。然后94℃加热变性1分钟,延伸1.5分钟,循环40周期,后再 60℃持续7分钟。第二轮PCR:在25.1μl总反应体积中含dNTP 2μl,内引物1对各1μl, Tth聚合酶0.1μl,第一轮PCR产物0.5μl。扩增条件:92℃加热1分钟。92℃变性50秒, 65℃退火1分钟,75℃延伸1分钟,共循环40周期。
4.PCR产物检测:取10μl第二轮PCR产物在1.4%的琼脂糖凝胶中电泳显带,并以碱性 磷酸酶标记的特异探针作Southern印迹,以化学染色(BICP/NBT)显示。
结 果
1.nested RT-PCR检测BDV ORFⅠ前部片段的方法学试验及灵敏度:以10fg/μl至10 0pg/μl呈10倍级差的不同浓度BDV标准品作方法学检测(图1)。结果表明实验方法准确可靠, BDV ORFⅠ的最低检测浓度为100fg/μl。
2.人体PBMC中BDV ORFⅠ基因前部片段的检测:对12例经p23检测证实存在BDV感染 的人体PBMC中进行ORFⅠ基因前部片段的检测。结果表明,所有待测样本检测全部呈阴性结 果。
图1 Nested RT-PCR检测BDV p40基因片段电泳图
Fig 1. Electrophoresis of BDV p40 gene fragment checked by nested RT-PCR (1-5:100pg/μl-10fg/&mu上一页 [1] [2] [3] 下一页 上一个医学论文: 核酸序列扩增系统与套式RT 下一个医学论文: 人类疱疹病毒7型DNA断裂包装位点序列分析
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