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同一乙型肝炎患者体内HBV S基因的多态性 |
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房德兴 甘人宝 李载平 翟春生 周宗安
作者单位:210002 南京,南京军区军事医学研究所(房德兴,翟春生,周宗安); 中国科学院上海生物化学研究所(甘人宝,李载平)
本研究受国家自然科学基金和江苏省自然科学基金部分资助
分析已发表的HBV全基因组或部分基因序列可以看出即使同一亚型也有很大差异, 建立中国人自然感染HBV的基因库对于该病毒的变异研究具有极其重要的意义,采用PCR扩 增、M13噬菌体克隆和核苷酸序列分析方法对一例HBV免疫失败儿童体内HBV HBsAg编码区 的全序列和部分前S2序列进行分析,结果发现4个重组噬菌体克隆的核苷酸序列(GenBank A ccession Numbers:AF036236,AF036237,AF036238,AF036239)存在值得注意 的以下两点:(1)HBsAg编码区nt376-nt378位为Thr密码子ACT,这与已知的所有adr亚 型HBV不同。根据Ohnuma等关于HBsAg第三对等位基因亚型决定簇(i/t)的 概念(Ohnuma H,et al.J Immunol,1990,145∶2265-2271),该患者感染的HBV显然是一个 adri→adrt变异株。鉴于在adw/ayw野生型HBsAg aa126位存在Thr(ACT),adri→adrt变异株 与临床免疫学的关系尚待进一步研究。(2)不同克隆间在9个位点存在碱基差异,分别为nt7 (A,A,C,A)、nt8(A,T,A,A)、nt17(C,A,C,C)、nt42(G,C,C,G)、nt44(G,G,C,G)、nt313(T,G, G,G)、nt327(C,C,C,G)、nt616(A,G,A,A)、nt728(C,C,T,C)。这种碱基差异反 映了在同一患者体内HBV S基因可能存在多态性。用同样方法对已知adr亚型HBV DNA〔甘人 宝等.中国科学(B辑),1986,1∶55-65〕进行分析,在随机挑取的3个重组噬菌体克隆中H BV DNA序列完全相同,并与预期的相符合,排除了方法学本身产生突变的可能性,肯定了上 述结论。
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