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脉冲场凝胶电泳分析耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 |
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后,由于其独特的优越性而立刻成为一种迅速、可靠、准确的细菌流行病学调查方法〔1〕。 我们用PFGE对38株临床分离的MRSA进行分型,经限制性内切酶SmaⅠ消化的MRSA染色体 DNA在脉冲场中电泳后,分析其酶切图谱,确定菌株的亲缘关系,从而了解MRSA在北京协和 医院及其它医院间的流行情况。
材料与方法
1.试验菌株:1995年4月-1996年3月自32位住院病人临床标本中分离到38株MRSA。 其中北京协和医院35株,北京东直门外医院、北京朝阳医院和解放军301医院各1株。标本 分离部位分别为痰50%,引流液13%,伤口脓液10%,阴道8%,血5%,其它14%。鉴定方法 采用葡萄球菌凝固酶和葡萄球菌A蛋白凝集试剂盒(法国梅里埃公司),用含NaCl 4μg/ml和 苯唑青霉素(Oxacillin)6μg/ml的Meuller-Hinton(MH)琼脂碟筛选耐甲氧西林株。
2.抗生素敏感性试验:琼脂稀释法测定MRSA对苯唑青霉素(Oxacillin,OX),氧氟沙 星(Ofloxacin,OF)、红霉素(Erythromycin,E)、甲氧苄啶(Trimethoprim,T)、 庆大霉素(Gentamicin,G)、壁霉素(Teicomycin,Tei)、利复平(Rifampin,R)、 万古霉素(Vancomycin,V)、磺胺甲基异 唑(Sulfamethoxazole,S)和磷霉素(Ph osphonomycin,P)的最小抑菌浓度。
3.PFGE
(1)染色体DNA的制备:在MH琼脂碟上挑取单个MRSA菌落种于5ml脑心浸液肉汤中,3 7℃振荡,过夜孵育。取0.5ml菌液于eppenddrof管中,8000r/min离心3分钟,弃上 清,加入TEN液(0.1mol/L Tris pH7.5,0.15mol/L NaCl, 1mol/L EDTA pH8.0)离心, 弃上清,加入0.3ml EC液〔6mmol/L TrisCl pH7.6,1mol/L NaCl,0.1mol/L EDT A pH7.5,0.2%脱氧胆酸,0.5% Sarkosyl(Sigma公司)〕,保温于50~60℃,加入1% EC液溶解的低熔点琼脂及10μl Lysostaphin(2μg/ml,Sigma公司)。混匀后倒入模子(1 0×5×1.5mm)中,置于4℃ 15分钟。取出凝胶块加入含15μl Lysostaphin的3ml EC 液中,37℃ 1.5小时溶解细胞壁。弃去EC液,加入3ml ESP液〔0.5mol/L EDTA pH8.0, 1% Sarkosyl,0.5μg proteinase K(Sigma公司)〕50℃过夜。弃去ESP液,加入3m l TE液和50mmol PMSF,室温放置2小时,重复3次后取出凝胶块置于TE液中4℃保存。
(2)酶切及电泳:首先将凝胶块放于50ml TEN透析液(10mmol/L TrisCl pH8.0,1m mol/L EDTA,20mmol/L KCl)中室温透析过夜。取出块切下2mm宽小条,置于100μl S maⅠ酶切缓冲液中4℃平衡30分钟,加入25U的SmaⅠ酶切过夜,140r/min振荡。电泳缓 冲液0.5 TBE液,1%PFGE琼脂倒成凝胶板,CHEF Mapper XA Pulsed Field电泳仪(Bio rad分司)中进行电泳,6V/cm,角度120。,温度14℃,20小时,脉冲时间5~45秒〔2~ 4〕。
(3)PFGE图谱的分型标准:酶切图谱差异3个条带以上者为不同的类型,3 条以下者为同 一型的不同亚型。暴发流行株的图谱定为A型,其余依次按照菌株分离时间命名为B型,C型。 同一型的各亚型间认为在基因上有相关性 ,而不同型的菌株认为在流行病学上无相关性〔5〕。
结 果
1.PFGE谱分析:经SmaⅠ酶切的MRSA的染色体DNA在脉冲场中电泳后,产生10~70
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