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昆虫中的mariner类转座子

个是H.irritans中的himarI元件,但是只有mosI元件是完全天然的,himarI则是根据共拷贝有7个核苷酸的不同〔7〕。mosI元件长1 286 bp,末端有28bp不完整的反向重复,中间为编码346个氨基酸的转座酶。mosI元件在生殖系和体细胞中均有活性,这与P-元件和hobo元件有很大不同〔4〕。D.mauritina次级家族中另一个元件desmarI,是从小麦瘿蚊(Mayetiola destructor)中由PCR扩增获得的,长1 288 bp,末端有完整的28 bp反向重复,与mosI元件反向重复有67%的同源性,它的转座酶序列与mosI元件非常相似,但是没有转座酶活性〔8〕。Brunet等人研究了mariner类转座元件在果蝇科中的分布,发现mariner类转座子主要存在于果蝇属(Drosophila genus)和Zaprionus属(Zaprionus genus)〔9〕。

1.2 H.cecropia次级家族

  H.cecropia次级家族的转座子最先在惜古比天蚕(H.cecropia)的抗菌肽A基因内含子中发现的,称“MLE”元件。此转座子长1 286 bp,末端有38 bp反向重复,但其中有2bp不匹配,与mosI元件序列同源性为48%;转座酶区域有一些缺失,与mosI元件转座酶的氨基酸同源性为56%,但没有转座活性〔10〕。这一次级家族还在家蚕(Bombyx.mori)基因组中发现,即bmMLE〔11〕。富田等人利用Robertson(1993)设计的一对引物,从家蚕基因组中扩增到501 bp的片段,用其制成探针,从家蚕基因组文库中筛选到mariner类转座子bmMLE。它在基因组中的拷贝数约为80~100,末端有不完整的32bp反向重复序列,长约1.9~2.0 kb,中间有620 bp的插入片段,两端还有另外的15 bp正向重复序列。Shiuchiro Tomita(1997)等用其两端反向重复序列配对的引物进行扩增,用扩增产物测序的结果来修正bmMLE,去掉其中的插入子、终止密码子和移码突变,得到一个理论上完整的转座子,与其它生物的mariner转座子相比,表明整个bmmLE均包含在H.cecropia的MLE元件中,系统发生关系也表明它与H.cecropia的MLE十分接近,属于H.cecropia次级家族。用与两端反向重复序列配对的引物对几个家蚕品种进行扩增,得到多种大小不等的带,其中4.2 kb、1.3 kb、3.8 kb存在于所有用于扩增的品种中,表明在家蚕中存在着很多种形式的bmMLE〔11〕。Robertson H M等人(1996)在家蚕蛾中也发现一个mariner转座子bmmarI,它是插入在幼虫血清蛋白基因5′端,在基因组中大约有2400个拷贝,两末端有28 bp反向重复,与其他mariner转座子不同的是,bmmarI有一个D,D(37)D基序(其他的MLE均为D,D(34)D基序)。通过比较转座酶的氨其酸序列和反向重复序列,表明bmmarI与bmMLE不同,bmmarI可能属于另一个次级家族,即D.mauritina次级家族,因为它与mosI元件关系更近一些。这同时也说明在同一种昆虫中存在着不同类型的mariner转座子〔12〕。

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