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河南省人免疫缺陷病毒流行株的基因亚型分析 |
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韩卫国 苏玲 王哲 邵一鸣 王春俭 李宏
【摘要】 目的 研究流行于河南省献血员中的人免疫缺陷病毒(HIV)外膜蛋白(env)基因亚型。方法 提取HIV感染者外周血单个核白细胞(PBMC)的DNA，经套式-聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增env基因片断，对C2-V3区350～450核苷酸顺序进行测定和分析。结果 20份样品的env基因序列与B亚型最为接近，基因离散率为8.34%，与其它国际亚型的基因离散率在20%以上；与流行于云南的B亚型毒株基因离散率为4.18%；样品间的基因离散率为3.4%。结论 流行于河南省献血员中的HIV属B亚型，并与云南的流行株密切相关；其在河南的流行时间在3～6年间。
【关键词】 人获得性免疫缺陷病毒Ⅰ型 基因亚型 变异
Genomic subtypes of HIV-1 in Henan province
HAN Weiguo, SU Ling, WANG Zhe, et al.
Henan Health and Anti-Epidemic Center, Zhengzhou 450003
【Abstract】 Objective To identify HIV-1 envelope sequence subtypes in infected blood donors from Henan province. Methods DNA extracted from PBMC were amplified in the presence of env fragment by nested-PCR. The C2-V3 region was sequenced and a phylogenetic tree was constructed. Results The overall env gene divergence is 8.34% between samples with HIV-1 B subtype, and 4.18% with reference strains of Yunnan origin. The sample gene divergence with other subtypes A, C, D, E is over 23%. The innergroup gene divergence of samples is 3.4%. The globally predominant GPGQ sequence at the tip of V3 motif is found in 11 strains (55%), typical European GPGR sequence were found in 7 strains (35%). Two strains contain a GPGK sequence. Conclusion These findings suggest the epidemic of subtype B of HIV-1 in Henan province and it is closely related to those identified in Yunnan province.
【Key words】 HIV-1 Genomic subtype Variability
根据人免疫缺陷病毒(HIV-1)基因组中变异性最大的膜蛋白基因(env)的核酸和其编码的氨基酸序列的同源性，目前已确定了由A-I，O至少10种HIV亚型，具有一定的地区性分布特点［1-3］。
自1995年起，河南省部分地区发现了一定数量的HIV感染的献血员，但对其所感染的HIV种类和来源均不清楚。为此，我们于1998年1～3月在部分地区采集了30例献血员的血样，对其中的20份血样进行了HIV亚型分析，现报告如下。
材料与方法
一、病例选择
30例献血员为1996～1997年间发现并经确证的HIV感染者，均无吸毒史，分别来自河南省三个地区。
二、样品收集和处理
每例采集静脉血5ml，用淋巴细胞分离液分离单个核细胞(PBMC)，常规方法提取细胞DNA，溶于TE液，置4℃备用。
三、膜蛋白基因扩增
按套式-聚合酶链反应(Nested-PCR)法［4］，设计合成多对PCR引物(表1)，以env-L/env-i为外侧扩增引物，进行第[1] [2] 下一页
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