72℃延伸10 min,置于4℃。(3)每个反应管中各取5 μl PCR反应物,加入适量TAE缓冲液及DNA凝胶电泳加样缓冲液,在0.8%~1%琼脂糖凝胶中电泳。
1.6 PCR产物的纯化(spinX纯化方法)。
1.7 Fd和轻链基因的克隆及噬菌体抗体库的建立
1.7.1 噬菌体载体pComb3 DNA的制备
将pComb3载体DNA转化XLIBlu感受态菌,挑取单个菌落接种入30~40 ml SBA+培养液,次日转种500 ml SBA+培养过夜DNA提取试剂盒1提取质粒DNA,最后制成5 μg/μl浓度左右的质粒DNA。
1.7.2 载体DNA和纯化PCR产物的酶切
首先将所有不同的重链PCR产物,κ链PCR产物,以及 PCR产物分别按各自组群混合。在pComb3系统中,用于重链插入的酶切位点为SpeⅠ和 XhoⅠ;而用于轻链插入的酶切位点为XbaⅠ和 SacⅠ。酶缓冲液的使用:酶切反应按常规进行,反应后进行电泳以纯化所需的片段。
1.7.3 Fd和轻链基因的克隆
(1)轻链抗体基因的克隆;取上述经XbaⅠ和 SacⅠ酶切消化,并经电泳纯化后的pComb3载体DNA 1.5~2 μg,轻链混合物500~700 ng,加2 μl高浓度连接酶进行连接。取事先制备好的电转感受态菌XLIBlue 400 μl加入上述连接产物,置冰浴中进行电转化。电转后立即转入细菌培养箱中。取30 μl培养液分别涂于含有氨苄青霉素的LB平皿,检测转化效率。用DNA纯化试剂盒制备上述含有轻链基因插入的pComb3质粒DNA,并测定DNA含量。鉴定插入效率,随即挑取20个克隆,提取质粒DNA后,用XbaⅠ和 XacⅠ酶切。(2)重链基因的克隆及噬菌体抗体库的建立:取上述的纯化pComb3LDNA质粒10 μg,混合的纯化重链PCR产物500 ng,用XhoⅠ和 SpeⅠ分别进行酶切反应。电泳回收相应的条带,纯化后测定DNA含量。取酶切消化后回收纯化的载体DNA及重链PCR产物进行连接。重复轻链克隆步骤。加入100 ml SBA+T+;37℃震荡培养1 h。加入1 012 pfu/ml的辅助噬菌体VSCM13,37℃震荡培养2 h。加入70 μg/ml卡那霉素,37℃震荡培养过夜。将上述细菌培养液于4℃以4 000 r/min离心15 min。取上清加入4%PEG8000和3%NaCl,待PEG和NaCl溶化后,置三角瓶于冰浴中沉淀30 min。于4℃以9 000 r/min离心20 min。用2 ml PBS(pH7.2)重悬噬菌体沉淀,瞬时离心,上清即为噬菌体抗体库,待用或存放于-20℃。
1.8 免疫印迹法鉴定初级抗体库中噬菌体上有Fab段的表达
将建成的噬菌体Fab初级抗体库悬液直接点于硝酸纤维膜(NC)片上,以pComb3噬菌体空载体悬液作阴性对照,进行免疫印迹分析,显色后对两组NC膜进行比较,鉴定初级抗体库中噬菌体上有Fab段的表达。
2 结果
2.1 大肠癌淋巴结抗体重链Fd基因和轻链基因的扩增及鉴定
采用Trizol一步法自大肠癌患者转移淋巴结中提取总RNA后,以其为模板RTPCR合成抗体重链Fd和轻链基因cDNA,再以该cDNA为模板,PCR扩增抗体重链Fd和轻链基因,在1%琼脂糖凝胶DNA电泳中,可获得650 bp产物条带,即为重链Fd和轻链基因产物,见图1。
2.2 轻链和重链Fd基因的克隆及噬菌体Fab抗体库的建立
将PCR扩增的轻链基因产物插入载体pComb3后,电转感受态XLIBlu菌,扩增培养后,测得转化菌数为4.7×106,随机挑取20个单菌落,提取质粒DNA,鉴定插入率为70%,见图2。将PCR扩增的重链Fd基因产物插入有轻链基因插入的pComb3载体DNA pComb3L,电转感受态XLIBlu菌,扩增培养后,测得转化菌数为3.5×106,随机挑取20个单菌落,提取质粒DNA,鉴定轻链基因的插入率为60%,见图3。
2.3 鉴定初级抗体库中噬菌体上有Fab段的表达
以辣根过氧化物酶(HRP)标记的羊抗人IgG行免疫印迹检测醋酸纤维膜上Fab初级抗体库,结果均显色
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