lele frequency of IVS13-98 G/T polymorphism (χ2=3.0257, P= 0.0820). hPOT1IVS13-98 G/T polymorphism was not correlated with H.pylori infection in gastric cancer. Conclusion Our results indicated that IVS13-98 G/T SNP of hPOT1 gene might be associated with reduced risk for gastric carcinoma, but not with H.pylori infection.
KEY WORDS: gastric carcinoma;human protection of telomeres 1 (hPOT1) gene; polymorphism; single nucleotide; Helicobacter pylori
胃癌是我国最常见的恶性肿瘤之一。目前研究表明胃癌是一种多基因病,其发生涉及到多种基因的异常改变,归因于环境与遗传因素的相互作用,其中幽门螺杆菌(H.pylori)感染是胃癌发生的主要危险因素,被WHO列为第一类致癌源。研究显示H.pylori是胃癌发生的启动和促进因子,感染率越高,胃癌发生率越高,死亡率越高[1]。研究中发现H.pylori感染能刺激胃黏膜细胞因子表达的增加,加重炎症反应,导致黏膜的损伤与胃酸分泌的异常,黏膜萎缩→肠上皮化生→异型增生→胃癌。在H.pylori感染导致胃癌发生的过程中,宿主的遗传因素也发挥十分重要的作用。单核苷酸多态性(SNP)指基因组中单个碱基的变异而导致的核酸序列多态性,是继微卫星之后的第3代遗传性标志,其决定了个体之间的差异暴露于相同的危险因素下,不同的人群有不同的结局。人端粒保护蛋白1基因(human protection of telomeres 1, hPOT1)是美国科学家Baumann等[2]于2001年发现的一种癌基因,是端粒家族成员之一,广泛存在于真核细胞中,被称为真核细胞看家基因。hPOT1的主要功能是维护端粒的功能,调控端粒长度,保护染色体稳定。hPOT1通过端粒酶依赖的途径负性调控端粒的长度,并导致端粒完整性破坏和不稳定性增加,引发DNA损伤反应,最终导致细胞凋亡。DNA损伤反应导致端粒功能失活,端粒功能失活限制了转化细胞的生长能力,使细胞永生化,也是肿瘤组织具有无限增殖能力的基础。H.pylori感染与hPOT1基因多态性的关系尚未见报道。为此在本研究中我们探讨胃癌中H.pylori感染与hPOT1基因单核苷酸多态性的关系。
1 材料与方法
1.1 研究对象
收集2005年12月至2006年7月期间甘肃西部武威市三家医院外科手术切除的150例胃癌患者的胃癌组织,包括部分临床病理学资料。患者术前未行放疗和化疗,所有病例均经组织病理学确诊。取癌组织及手术切缘正常组织(距癌组织5 cm以上),立即置于-70 ℃冰箱冻存备用。156例正常对照组为同期在三家医院查体并行胃镜检查者,在胃镜下排除慢性胃炎、肠化、增生、溃疡及癌变后,对照组年龄、性别与胃癌组匹配。两组均征得患者同意,所有受试者均签署知情同意书。胃癌组男性114例,女性36例,年龄31-76岁,平均55.93岁;对照组男性118例,女性38例,年龄28-73岁,平均54.63岁,全部检查对象均抽静脉血5 mL分离淋巴细胞,-70 ℃冰箱冻存备用。采用常规酚氯仿异戊醇抽取法提取DNA。
1.2 hPOT1基因单核苷酸多态性检测
1.2.1 SNP位点选择
从http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP网站和NCI/CGAP /http:// snp500cancer.nci.nh.gov网站[3] 公布的hPOT135个SNP位点中,选择其中等位基因频率大于5%且有酶切位点的SNP位点hPOT1 IVS13-98G/T(ID:rs10250202);引物参照数据库中SNP位点周围的序列,由作者设计,上海生工合成。引物序列为:F-5′-GAGAATAGTCAGCCTCATTGTTTTT-3′,R-5′-TCTGATGCTGGAATCTGGAAG-3′,片段大小312 bp。
1.2.2 PCR扩增酶切测序
采用PCR-RFLP法。PCR扩增反应体系总体积25 μL,DNA模板300 ng、引物各1 μL(10 μmol/L)、2×Taq PC
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