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慢性阻塞性肺病TNFA和LTA基因等位基因变异分析

一个片段,G等位基因存在NcoⅠ酶切点被切成235和133 bp两个片段。所以,在电泳后AA基因型为368 bp一个片段;GG基因型为235和133 bp两个片段 ;AG基因型为368、235和133 bp三个片段。

  2.2 HardyWeinberg平衡检验结果

  在TNFA和LTA基因中,COPD组、对照组各种基因型频率的分布符合HardyWeinberg平衡规律。

  2.3 TNFA基因

  308G/A多态性位点基因型和等位基因频率的分布 见表1。COPD组与对照组比较,TNFA基因308G/A多态性位点AA基因型频率分布差异显著(分别为18%和2%;χ2=7.111,P=0.008),OR为10.756(95%CI为9.875~12.640)。308G/A多态性位点A等位基因频率差异显著(χ2=8.219,P=0.004)。表1 TNFA基因308G/A多态性位点基因型和等位基因的频率分布〔n(略)〕

  2.4 LTA基因+252A/G多态性位点基因型和等位基因频率的分布

  见表2。COPD组与对照组比较,LTA基因+252A/G多态性位点AG基因型频率分布差异显著(χ2=11.974,P= 0.001),OR为4.373(95%CI为3.301~6.872)。LTA基因+252A/G多态性位点G等位基因频率差异不显著。表2 LTA基因+252A/G多态性位点基因型和等位基因的频率分布〔n(略)〕

  2.5 TNFA和LTA基因多态性位点基因型组合关联分析

  根据Warzocha等提出的高风险和低风险基因型,将所有可能的基因型组合分为两组〔4〕,仅存在一个与细胞介素高产物关联的等位基因(TNFA基因A等位基因或LTA基因G等位基因)的基因型组合属于低风险组:即GGAA,GGAG,GAAA组合。与TNFα或LTα增高分泌作用有关的两个以上等位基因的基因型组合列入高风险组:即GGGG、GAAG、GAGG、AAAA、AAAG、AAGG结合。基因型组合频率分布,见表3。COPD患者组与对照组之间高风险和低风险基因型组合频率无显著差异(χ2=0.10,P=0.73)。表3 TNFA和LTA基因多态性位点基因型组合关联分析〔n(略)〕

  3 讨 论

  本研究结果提示,TNFA基因AA基因型与我国COPD患者的易感性明显相关。与相关资料比较,本研究COPD患者TNFA基因A等位基因频率与日本和韩国COPD患者TNFA基因A等位基因频率相似〔5〕。但欧洲COPD患者中TNFA基因A等位基因与发病无关联。意大利COPD患者308A等位基因频率为11%,欧洲出生健康个体组和非阻塞性支气管炎患者组为10%,这与相应对照组A等位基因频率高有关系(8%~27%)。此外,Kucukaycan等〔6〕分析TNFA基因4个多态性变异发现+169G/A多态性与COPD关联,而等位基因308G/A、376G/A、238G/A变异未参加到疾病发生中。

  本研究结果还显示COPD组与对照组比较,LTA基因+252A/G多态性位点AG基因型频率显著增高(P<0.01),但G等位基因频率与A等位基因频率差别不大。患者组和对照组的LTA基因G突变等位基因频率为30%,这可能与研究的病例数较少有关。 Patuzzo等〔7〕研究了意大利COPD(n=66)患者LTA基因+252A/G多态性,未发现TNFA和LTA基因多态性变异与发病之间的关系。Yamaguchi等〔8〕研究日本的结节病患者的多态性发现,G等位基因是慢性病程标记基因。

  一些研究表明,LTA基因突变可以影响LTα表达水平,可能对COPD发病机制具有意义。但是这个细胞介素生物学功能目前很少研究。已知LTA基因突变等位基因G与人类外周血单核细胞介素更多产物关联。此外,发现G等位基因处于与LTA基因编码区域的突变连锁,它引起蛋白质产物26位天门冬酰胺替代苏氨酸(Thr26Asn),可以影响LTα生物活性水平。但是为了证实这个假说尚需要进一步的研究。

  Boichenko等研究人外周血淋巴细胞发现NFκB因子诱导和LTα诱导之间相关。而NFκB转录因子是炎症应答的许多基因表达调控的主要因子之一〔9〕。在氧化剂、细菌、病毒和不同抗原等作用下活化合成炎症细胞介素TNFα、IL1β、IL2、IL6、巨噬细胞和粒细胞克隆刺激因子,以及参加COPD病理过程的IL8。分析TNFA和LTA基因多态性位点基因型组合,每一个COPD类型可以划分出是标记基

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