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结核病分子流行病学的概况和进展

。(5) 直接可变重复间隔寡型(DVR spoligotype)技术,用于牛分支杆菌。

  3.指纹技术中出现的问题和对策:(1)探针:插入要素为插入染色体DNA内能多倍重复的序列,大多采用IS6110作探针,它与IS986、IS987三者都属于IS3的家族,存在于所有结核分支杆菌群中,但IS6110不适于牛分支杆菌,要换用IS1080。第3种探针是质粒pTBN12,是富含鸟嘌呤和胞嘧啶的重复序列(PGRS)和直接重复探针。第4种是短串联重复序列(major polymorphism tandem repeat,MPTR)。(2) DNA指纹图谱:结核分支杆菌DNA系列基因存在多态性,不同菌株有不同数目和不同部位的DNA系列基因。多态性:在RFLP图谱上呈零带谱或只有一个带谱(拷贝)者,为无效图谱;有的严格规定5个带谱以上才能进行比较分析,一般都在10个左右。Das等[5]在南印度的检查有40%的IS6110图谱仅有1个拷贝,泰国1997年检查为29%呈1个拷贝,越南为20%[17]。稳定性:指纹另一特征为大多具有稳定性,不稳定者仅占5.6%~8%,如瑞士、德克萨斯和香港地区。稳定性还表现在细菌的敏感性与耐药性上,已有多篇文献明确提出耐药性不影响RFLP图谱,也就是在RFLP上区别不出耐药与否[1,2,18]。集簇性(clustering):细菌菌型相似或相同,则可归入一个集簇或簇,一般一个簇有2~6例患者,暴发流行时会增多。

  我国的一篇报道未发现零带谱,而在3~15个带谱,多数在5~10个IS6110拷贝,未提及簇,可能会在下一步流行病学分析中提出。

  我国还是可能会遇到无效带谱,因为最近又在旧金山发现不含IS6110者,都为中国或越南人[19]。另一报告,179例中有3例亚洲和非洲人为单一拷贝[20]。已报道的除了东南亚的中国、蒙古、韩国、泰国、马来西亚、越南,还有南亚的印度、巴基斯坦,再往西,也门、坦桑尼亚等国人也有此表现,一旦遇到,做了IS6110的RFLP后,要补充一种探针如MPTR,或PGRS,或直接重复序列,或pTBN12,指纹技术除RFLP外还要另加PFGE或spoliogtyping才行。

  四、发展中国家开展结核病分子流行病学的重点

  发达国家无一例外地已开展了DNA指纹研究,并日趋深入、持久、广泛,多数已将其列入常规检查,究其原因,有两个方面:一是有足够的基金支持,人才技术和仪器设备;另一个是结核病呈低发流行,各国每年新发菌阳患者不多,有能力全部进行检查,而且以家族传播为主,很少进行定期大规模流调。检查方式大多采用回顾性,将常规存档入库的培养物进行指纹检查,再结合人口统计学资料(性别、年龄、种族、出生地、所在地)、临床表现、治疗情况和随访结果作有关分析[5-7,19-22]。

  发展中国家绝大多数是结核病高发流行地区,病例众多,但资金、技术、设备短缺,不能照搬;我国已开展第四次流调,理想的是把指纹检查结合进行,但实际上不太可能。指纹检查用于


流行病学研究的意义和内涵,在结核病的控制方面存在着良好的前景,会有越来越大的效益,遵循有所为有所不为的原则,有条件的科研院所,可以有重点地开展研究。Cohn和O′Brien[23]于1998年已给发展中国家提出3个重点:① 社区人群传播;② 医院内传播;③ HIV相关的结核病。

  我们应该在这3个重点中再抓一些重点,继续作一些开拓性的研究。

参考文献

  1.李传友,马玙,邢爱英,等.DNA指纹技术方法学的建立及在结核分支杆菌菌株鉴定中的应用.中华结核和呼吸杂志,1999,22∶142-144.

  2.张天民.结核病分子流行病学进展.中华流行病学杂志,1998,19(5-B)∶235-239.

  3.Kiers A, Drost AP, van Soolingen D, et al. Use of DNA fingerprinting in international source case finding during a large outbreak of tuberculosis in the Netherland. Int J Tuberc Lung Dis, 1997,1:239-245.

  4.Godfrey-Faussett P, Githui W, Batchlsr B, et al. Recurrence of HIV-related tuberculosis in an endemic area may be due to relapse or reinfection.

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